虫歯が深く進行して歯髄（歯の神経）まで達すると、歯髄は細菌に汚染されて痛みが出たり、時には化膿して歯肉を腫らします。
汚染された歯髄をそのままにして置くと、歯だけでなく周囲の骨や歯肉まで細菌に汚染され、結果として歯やその周りの骨まで失うことにも成り兼ねません。ですからそれ以上の感染を防ぎ歯を現すためには、汚染された歯髄を取り除き、根の中を清掃、消蕃して薬剤をつめ、組織の回復を待ちます．この治療を「根管治療」と言います。
根の中の歯髄のあるところはとても細く、時には曲っていたりもします．そこに薬をつめることは、目で見えない作業であるにもかかわらず、正確さを必要とし、医師にとっても大変です。又、患者さんにとっても痛みや腫れを伴うことが有り、治療中もずっと口を開けていなければならないのでやはり大変です。しかし、この治療をしっかり済まさなければ、歯を救うことは出来ません．根気良く頑張って最後まで治療を続けることが大切です。